MOTS-c необычен в этом каталоге ещё до всякой химии: он не закодирован в ядерной ДНК. Последовательность находится внутри митохондриального генома, в гене 12S рибосомной РНК, и название просто описывает этот адрес — митохондриальная открытая рамка считывания 12S рРНК, тип c. Его выделили и описали в Cell Metabolism в 2015 году.
Практическая половина страницы короче и полезнее. Пептид состоит из шестнадцати остатков и весит 2174,6 г/моль, и два из этих остатков — метионин. Один этот факт определяет, что обязан разделять сертификат и как следует хранить порошок.
- MRWQEMGYIFYPRKLR — 16 остатков, 2174,6 г/моль, CAS 1627580-64-6.
- Формула C101H152N28O22S2; два атома серы — это два метионина, в положениях 1 и 6.
- Два метионина дают три окисленные формы, а не одну: +16 к любому из них и +32 к обоим.
- Триптофан в положении 3 и тирозины в 8 и 11 дают заметное поглощение при 280 нм — у большинства коротких пептидов его нет вовсе.
- Закодирован внутри митохондриального гена 12S рРНК, а не в ядерной ДНК.
Что говорит название
Названия пептидов обычно непрозрачны. Это — нет: оно прямо указывает, где лежит открытая рамка считывания. У митохондрии собственный небольшой кольцевой геном, и ген 12S рибосомной РНК — одна из его частей; рамка MOTS-c находится внутри этого гена. Считать пептид с гена структурной РНК — именно это и сделало находку заметной, и поэтому в литературе соединение называют пептидом митохондриального происхождения, а не просто пептидом.
Для покупателя следствие узкое, но реальное: это определённая последовательность из 16 остатков с номером CAS, получаемая синтезом, как и всё остальное здесь. История происхождения объясняет название, а не способ производства.
Последовательность и её состав
Развёрнуто: Met-Arg-Trp-Gln-Glu-Met-Gly-Tyr-Ile-Phe-Tyr-Pro-Arg-Lys-Leu-Arg. Четыре позиции из шестнадцати стоит назвать поимённо — каждая проявляется либо в анализе, либо в отчёте о стабильности.
| Положение | Остаток | Почему важно |
|---|---|---|
| 1 и 6 | Метионин | Окисляется до сульфоксида, прибавляя по 16 г/моль; два метионина дают три разные окисленные формы |
| 3 | Триптофан | Тоже склонен к окислению и является сильнейшим УФ-хромофором молекулы |
| 8 и 11 | Тирозин | Поглощают при 280 нм вместе с триптофаном |
| 2, 13, 14, 16 | Arg, Arg, Lys, Arg | Четыре основные боковые цепи — места, которые занимает противоион ацетата или трифторацетата |
Формула проверяет сама себя. В C101H152N28O22S2 ровно два атома серы, а метионин — единственный серосодержащий остаток последовательности: цистеина здесь нет, а значит нет и ни одного дисульфидного мостика. Два атома серы, два метионина и молекула, форма которой не зависит от связи, способной спариться неправильно.
